《生物信息检索与论文写作》复习思考2011年6月：
1、信息素养或素质的具体内容有那些？
信息素质是指用户在利用以计算机及其网络技术为代表的现代科学技术进行知识学习、成长的过程中，逐步形成的制动参与信息活动、自觉应用信息技术的意识、态度、理念及具备的获取、识别、加工、处理、传递、创造信息的能力和利用信息去解决实践问题的能力。它包括强烈的信息意识、系统化的信息理念、综合信息能力等内容。
2、信息、知识、情报、文献的概念？文献的组成要素？
信息的概念：
1、信息是人们根据一定目的和需要，把从自然现象和社会现象中搜集的原始材料进行加工、处理，找出其中关系而形成的对象实体。
2、信息是有一定含义的、经过加工处理的、对决策有价值的的数据，即信息=数据+处理
3、信息是人们对数据进行系统组织、整理和分析，使其产生相关性，但没有与特定用户行动相关性的实体对象，信息可以被数字化。
知识的概念：知识是指人们在认识世界、改造世界中所获得的认知，包括通过阅读、学习等方式的认知和通过自己或他人的历练所积累的一切经验的总结。 情报的概念：是被人们所利用的信息、被人们感受并可交流的信息。 文献的概念：是记录有知识的一切载体。
文献的组成要素：不但包括现代图书馆的全部馆藏，同时也包括了档案馆、博物馆、声像馆和情报中心收藏的全部馆藏。
3、信息、信息资源包括那些类型？
1）信息的类型：从产生信息的客体的性质来分，可分为自然信息(瞬时发生的声、光、热、电、形形色色的天气变化、缓慢的地壳运动、天体演化……)、生物信息(生物为繁衍生存而表现出来的各种形态和行为，如遗传信息、生物体内信息交流、动物种群内的信息交流)、机器信息(自动控制系统)和(人类)社会信息。以信息所依附的载体为依据，可分为文献信息、口头信息、电子信息、生物信息等
信息资源类型：根据存储媒介不同，信息资源可以划分为印刷型信息资源、电子信息资源、数字信息资源和多媒体信息资源。
4、文献有那些类型？将文献划分成这些类型的依据是什么？
1）根据载体材料、存储技术、和传递方式划分
可划分为：印刷型、缩微型、试听型和机读型文献信息源 2）根据加工程度的不同划分
可分为：一次文献信息源、二次文献信息源、和三次文献信息源 3）根据文献信息源的内容划分
可以分为：图书、期刊、报纸、科技报告、政府出版物、会议文献、专利文献、学位论文、标准文献、档案文献、产品样本
5、信息（文献）检索的方法与途径，详细论述检索步骤？
(1)、分析研究课题，明确检索要求：分析课题的主要内容、确定课题的文献类型、确定检索时间范围、分析用户的检索评价要求
(2)、选择检索工具：根据检索课题的要求，选择最能满足检索要求的检索工具书，不同的资料类型就应该选用不同的数据库 (3)、确定检索策略：确定检索途径、制定检索策略
(4)、调整检索方案：确定了具体的检索方法之后，就要利用所用数据库，在一定的年代范围内具体查找，以获得文献线索。用户对每次检索结果在作出判断，并对检索策略做出相应的修改和调整，知道得到满意的结果
(5)、获取原文：利用全文数据库直接获取，利用文献传递系统获取、利用文摘数据库的原文服务、利用OPAC检索系统，进行馆际互借。
6、信息检索策略有哪些，怎样综合使用它们？
积木型策略：把检索课题剖析成若干不同概念面，分别对它们检索，并在各概念面中尽可能多地列举同义词、相关词、近意词，用布尔算符OR或＋联结成子检索式，再用布尔算苻AND或*把所有子检索式联结在一起，构成总检索式。优点：提供较明确的检索逻辑过程，容易理解执行，适合复杂的多概念检索课题。缺点：各概念面不是逐个加入检索，而是一次性组配得到检索结果，出现问题难确定原因在哪里，迅速有效地做出针对性改进。
引文珠型增长策略：从已知的关于检索问题的少数几个专指词开始检索，以便至少捡出一篇命中文献或一条相关信息，再审阅这批文献，选出新的相关检索词，补充到检索式中，查出新的命中结果。不断重复，直到找不到其他合适包含于本检索式的附加词为止。优点：直接、灵活，能极大发挥人机交互的优势，使检索词选择的有效性和针对性提高，有利于取得更理想的检索结果。缺点：需审读文献，要较多的思考时间，需要有丰富的领域知识。
逐次分馏策略：先确定一个相当大、范围较广的检索初始对象集合，再提高检索的专指度，得到一个较小的命中结果集合；继续提高检索式的专指度，一步一步缩小命中结果集合，直到得到数量适宜、用户满意的结果为止。优点：有利于保证检索的全面性，如能在适当的条件下加以利用，可取得较高的查全率。缺点：比较耗时
最专指面优先策略：选择从课题中最专指的概念面入手，浏览结果后如发现检得的文献已经比较专指，通常就不需要把其他概念面加入到检索式中去。若检出的结果不够专指，再将供选择用的其它概念面加入到检索式中，以便获得最高的查准率。
在检索中，应根据课题的内容特征、自身的领域知识优劣以及对各种策略的使用熟悉程度来选择不同策略：若所需的资料量较少，无特别的要求，最专指面优先策略和逐次分馏策略比较常用；但若所需文献量多，需深入全面了解，引文珠型增长策略就相对比较好用；积木型策略则适合概念复杂的课题，并且需要检索者对此课题有一定理解并列举出各种类的关键词。几种策略并不一定要分开使用，可根据情况相互结合嵌套，以发挥最大优势，即适合的才是最好的。
7、结合经验，怎样利用图书馆数据库找需要的中外文献？
从图书馆进入，选择合适的文献库（学校内的网络可以直接登陆，校外网络需要用学号密码登陆），进入初级检索，利用关键检索词寻找匹配文献（如提名、关键字、主题或作者等）。若检索出的文献太多无法识别过滤，就使用高级检索引擎，利用各种逻辑关系与关键词的结合来寻找所需文献，可以结合日期、学科等各种要素，结合不同手段、途径、策略、程序一起查找。
一般来说先输入领域专业方面关键词，如认知发展或SDT等，然后在结果中进一步查找，比较容易击中所需的东西。
在搜索出的结果中，利用摘要、预览等浏览模式，先大致了解这些文献是否是自己需要的，然后再根据情况下载PDF、CAJ、txt等格式，论文类全文下载或期刊书本类部分下载。另外，在下载时最好将文件名改为标题-作者格式，一方面在后期查找比较方便，另一方面也防止在其它检索库找到相同文献却没发现而重复下载。
8、简述“超星电子图书馆”、“书生之家数字图书馆”、“中国学术期刊全文数据库”、“维普中文科技期刊数据库”和“万方数字化期刊”收藏资源的特点
1)、超星电子图书馆：收录的电子图书内容丰富，包括经典理论、哲学、社科、经济、语言文字、文学、数理化、生物、工业技术、计算机等50余个学科门类，现拥有中文电子图书80万种，论文300万篇，全文总量4亿余业，并且每天仍在不断地更新与增加
2）书生之家数字图书馆：主要收录1999年以后出版的新书，其收录量为每年中国出版的新书品种一半以上，目前拥有图书15万种，数量可观，学科门类齐全。
3）中国学术期刊全文数据库：该库的产品分为十大专辑：理工A、理工B、理工C、农业、医药卫生、文史哲、政治军事与法律、教育与社会科学综合、电子技术与信息科学、经济与管理。个专辑分为若干专题，共168个专题。
4）维普中文科技期刊数据库:按照《中国图书馆分类法》进行分类，所有文献被分为8个专辑：社会科学、自然科学、工程技术、医药卫生、农业科学、经济管理、教育科学和图书情报。8大专辑又被细分为36个专题 。
5）万方数字化期刊收藏资源的特点：目前集纳了理、工、农、医、人文五大类70多个类目，2500多种科技类核心期刊，实现全文上网。该系统收录的期刊种类主要有7个：基础科学、农业科学、社会科学、哲学政法、医学卫生、教科文艺、经济财政。
9、结合“中国学术期刊全文数据库”、“维普中文科技期刊数据库”两种数据库，谈各自的“高级检索”的方法
1)、维普中文科技期刊数据库“高级检索”的方法：打开维普数据库，点击高级检索，输入关键词、作者、分类号、机构、刊名，扩展检索条件，如：时间条件、专业限制、期刊范围，然后点击检索。 2）、中国学术期刊全文数据库“高级检索”的方法：打开中国知网，点击高级检索，进入中国学术期刊全文数据库，输入检索控制条件，如：发表时间 来源期刊`期刊年期
支持基金，然后输入内容检索条件。
10、简要回答：三大检索工具SCI，EI和ISTP的内涵 (1)、SCI ，即《科学引文索引》，是自然科学领域基础理论学科方面的重要期刊文摘索引数据库。
它创建于1961 年，创始人为美国科学情报研究所所长 Eugene Garfield(1925.9.15).利用它，可以检索数学、物理学、化学、天文学、生物学、医学、农业科学以及计算机科学、材料科学等学科方面自 1945 年以来重要的学术成果信息；SCI 还被国内外学术界当做制定学科发展规划和进行学术排名的重要依据。
(2)、Ei，即《工程索引》,创刊于 1884 年,由 Elsevier Engineering Information Inc.编辑出版。主要收录工程技术领域的论文（主要为科技期刊和会议录论文 ) ,数据覆盖了核技术、生物工程、交通运输、化学和工艺工程、照明和光学技术、农业工程和食品技术、计算机和数据处理、应用物理、电子和通信、控制工程、土木工程、机械工程、材料工程、石油、宇航、汽车工程等学科领域。
(3)、ISTP ，即《科学技术会议录索引》，创刊于 1978 年，由美国科学情报研究所编制,主要收录国际上著名的科技会议文献。它所收录的数据包括农业、环境科学、生物化学、分子生物学、生物技术、医学、工程、计算机科学、化学、物理学等学科。从 1990-2003 年间， ISTP 和 ISSHP( 后文将要讲到 ISSHP) 共收录了 60 ， 000 个会议的近300 万篇论文的信息。
11、
网络NCBI提供检索的服务包括哪些方面？
12、学术论文一般由哪几部分构成？各部分的写作规范分别是什么
(1)、标题：准确、精炼的技术术语表达的创新点名称
(2)、单位和作者：只写作者和实际参与了论文写作的人名，按对论文而不是工作的贡献排序。
(3)、摘要：是论文不加注释和评论的精炼缩写，是一篇独立的短文。 (4)、关键词：关键词是表达论文所属门类的主题词。列出能通过模糊检索查到这篇文章的3～8个主题词。关键词要反映研究范围，但不一定是文中的高频词，排列最好按范围，先大后小。关键词忌生僻，最好出自《中文主题词表》。
(5)、引言：引言可以作为论文的一节（符号可以是0、可以是1），也可以是正文前的一段无标题文字。应鲜明简洁，不要图表、公式。
(6)、正文：正文要分节，合理分节并拟定小标题可以突出重点，有助于理解。要尽量多用图表直观地表达，图表要有自明性，使用中文表头、坐标，无需解释就能看懂。
(7)、结论：全文而不仅是试验或仿真的总结。①归纳研究中发现的规律、优点；②应用或应用方向；③局限或不足，今后努力方向。结论应相对独立，提到创新点时不应使用“该方法”之类代用词。不十分肯定时可用“讨论”代替“结论”，但不得使用“结束语”、“小结”之类标题。结论中不应有图表、公式。
(8)、参考文献：列出作者在研究范围内所看过的国内外文献。参考文献与引言呼应，反映作者跟踪技术发展的眼界和敏锐性，反映作者知识的广度和深度，反映作者有资格说自己是创新。数量不可过少，例如中国科协期刊优秀论文评选要求研究性学术论文参考文献不少于20篇。参考文献不限于中文但，教科书不可多，不宜过陈旧。
13、综述性论文与实验研究论文的特点与写作要求
综述的特点：①综合性：综述要"纵横交错"，既要以某一专题的发展为纵线，反映当前课题的进展；又要从本单位、省内、国内到国外，进行横的比较。只有如此，文章才会占有大量素材，经过综合分析、归纳整理、消化鉴别，使材料更精练、更明确、更有层次和更有逻辑，进而把握本专题发展规律和预测发展趋势。 ②评述性：是指比较专门地、全面地、深入地、系统地论述某一方面的问题，对所综述的内容进行综合、分析、评价，反映作者的观点和见解，并与综述的内容构成整体。一般来说，综述应有作者的观点，否则就不成为综述，而是手册或讲座了。 ③先进性：综述不是写学科发展的历史，而是要搜集最新资料，获取最新内容，将最新的信息和科研动向及时传递给读者。 综述不应是材料的罗列，而是对亲自阅读和收集的材料，加以归纳、总结，做出评论和估价。并由提供的文献资料引出重要结论。一篇好的综述，应当是既有观点，又有事实，有骨又有肉的好文章。由于综述是三次文献，不同于原始论文（一次文献)，所以在引用材料方面，也可包括作者自己的实验结果、未发表或待发表的新成果。
综述的内容和形式灵活多样，无严格的规定，篇幅大小不一，大的可以是几十万字甚至上百万字的专著，参考文献可数百篇乃至数千篇；小的可仅有千余字，参考文献数篇。一般医学期刊登载的多为3000～4000字，引文15～20篇，一般不超过20篇，外文参考文献不应少于1／3。
综述的内容要求
选题要新：即所综述的选题必须是近期该刊未曾刊载过的。一片综述文章，若与已发表的综述文章"撞车"，即选题与内容基本一致，同一种期刊是不可能刊用的。
说理要明：说理必须占有充分的资料，处处以事实为依据，决不能异想天开地臆造数据和诊断，将自己的推测作为结论写。
层次要清：这就要求作者在写作时思路要清，先写什么，后写什么，写到什么程度，前后如何呼应，都要有一个统一的构思。
语言要美：科技文章以科学性为生命，但语不达义、晦涩坳口，结果必然阻碍了科技知识的交流。所以，在实际写作中，应不断地加强汉语修辞、表达方面的训练。 文献要新：由于现在的综述多为"现状综述"，所以在引用文献中，70％的应为3年内的文献。参考文献依引用先后次序排列在综述文末，并将序号置入该论据(引文内容)的右上角。引用文献必须确实，以便读者查阅参考。
校者把关：综述写成之后，要请有关专家审阅，从专业和文字方面进一步修改提高。这一步是必须的，因为作者往往有顾此失彼之误，常注意了此一方而忽视了彼一方。有些结论往往是荒谬的，没有恰到好处地反应某一课题研究的"真面目"。这些问题经过校阅往往可以得到解决。
14、简述写好一份大学生生物科学研究项目申请书的基本要求？
(1)、题目要新穎。要突出新思想、新概念、新构思、新理论、新方法、新技术；画龙点睛——要在题目中用关键词点明拟研究项目的特色、创新，此关键词应是申请项目在该领域内、国内外最有学术价值的突破点、创新点和特色，此关键词应是申请书论证围绕的中心。 (2)、项目信息简表。学科代码的填写：交叉学科项目应注意填写相关科学部学科代码，鼓励学科交叉；申报哪个学科是指主要研究内容和突破点所在学科；合作单位：鼓励国际国内（企业）合作研究；经费预算：要尽可能细化、准确、实事求是；项目组主要成员：研究队伍结构合理（年龄、职务职称）、精干（数量合理）。
(3)、立项依据：研究意义：研究背景、学术价值和应用前景（应用基础研究应突出工程中的关键科技问题）；国内外研究现状及分析(Why) ：围绕主要研究内容和可能的突破点，展开国内外研究情况，论证创新点或研究特色。参考文献：新的国内外最有代表性的论文.(4)、研究内容、目标、方案（What / How)。研究目标：有所创新的具体的理论及技术研究目标，而不仅是论文××篇，研究生××名等；研究内容和拟解决的关键问题（难题）：研究内容应尽可能细些，关键问题不可过多，3－5个为宜，应紧紧围绕可能的突破点展开；研究方案及可行性分析：要让评审人在原理、方法上而不是具体工艺上了解你的方案和技术路线；创新性强的项目尤其要论证好可行性。 (5)、项目特色与创新(保护创新）。源头创新与跟踪创新；原理创新、方法创新还是技术创新；特色/创新的表述：应是国内外研究现状分析中特色/创新论述的提炼和概括；特色/创新的基础和条件。
(6)、年度计划/预期研究成果。年度计划尽可能细而具体些；理论成果及成果提交形式（论文/专著）；方法/技术成果及成果提交形式（论文/专利/工艺/仪器/装备原型）；人才培养及成果提交形式. (7)、与其它项目的关系。与原完成的和正在承担的基金项目的关系；与正在承担的其它相关项目的关系；实事求是而充分填写；阐明其特点（其它项目未做过的、在原来项目完成基础上提出的、具有重要的学术意义和创新点的内容）。
(8)、申请者承担基金项目的完成情况－－－绩效挂钩。实事求是而充分填写原承担完成项目的情况（注意突出主要有显示度的成果）；必须按要求标注基金资助项目的成果（如：国家自然科学基金资助项目，资助号：50275136）；所附代表性论文和其他成果一定要标注。 (9)、附件。国际合作协议书（协议书视同一份同行评议）；国内合作协议书（制造技术基础研究项目鼓励与企业合作）；国外专家参加项目的信件；发明专利附件；推荐信。 (10）、结论。
①命题要新:新思想、新概念、新构思、新理论、新方法、新技术；论述要清楚（why/what/ how) ：Why—立题意义、国内外研究现状及发展趋势；What—重要研究内容/关键科学问题（难题)/主要创新点/预期成果;How—研究方案/研究基础及条件。
②选好题。调查研究/结合实际/找到切入点(创新和特色)；申请书是给评审专家看的，“Why/How/What”中, “Why”最重要；鼓励交叉、保护创新、绩效挂钩、支持合作。
③瞄准学科前沿，鼓励学科交叉。
15、简谈论文投稿技巧。
(1)、投稿前，先在中国期刊网、维普科技期刊，图书馆《期刊园地-投稿指南》上查询一下期刊的合法性、正规性、级别，避免误投非法出版物。。
(2)、可以先根据期刊提供的邮箱从网上投稿，合法期刊一般会回复要求你寄稿件的软盘、审稿费、单位介绍信等，部分期刊要求第一作者简介。切记：未回复者尽量不要再投稿。寄稿时一定按杂志社要求做，否则补寄资料就会耽误论文发表时间。
(3)、有时你会莫名其妙收到约稿，或论文发表通知书，要求你寄版面费，读者一定要慎重对待，建议不要在这样的刊物上发表论文，这样的刊物一般都是非法出版物。一旦你在这样的杂志上发表了论文，也算公开发表，既不能在其他正规刊物上再次发表，又损失了钱，白白浪费一篇论文。
(4)、一般往核心期刊和统计源系列期刊投稿有一定的难度或时间较长，这些期刊审稿较为严格，所以建议也可以把稿件投到相关的边缘杂志。
(5)、投稿前最好先看一下欲投期刊近几期发表过的论文，因为很多杂志发表论文有共性，即每期重点或集中发表某主题的文章，且有周期性，一旦你的论文内容相关主题刚刚发表不久，暂时不要投稿，除非你的论文独特、新颖、实用性强，否则要等到下一个周期才有可能发表（一般半年到一年左右）。
(6)、一旦收到稿件修改通知，只要按照编辑要求修改，发表的可能性在95%以上，可以先询问稿件发表的版面费，可以在寄修改搞的同时把版面费一同寄去（事先最好电话联系），以免等收到发表通知后寄版面费耽误时间，编辑在收到版面费后可能会帮你进一步修改以便发表。
(7)、会议上发表的论文属于内部交流，可以在修改后再投寄到期刊上发表。
(8)、有知名学者指导的论文一定要加以说明，或署名第2作者，这样发表的机会最大。 (9)、如果是参加了国家自然基金、省基金或其他纵向科研课题项目，应标注在文章上，以证实文章的价值。
