为防范农村信用社经营风险，规范信用社治理和经营，内控制度的建立十分必要。内控制度是农信社规范自身经营行为，以科学化、法制化为基本理念实行自我约束的制度性建设。建立和完善信用社内控体系，促进信用社治理科学化、制度规范化、经营法制化，是信用社当前和今后一项十分重要的工作任务。
一、农村信用社内控制度建设存在的新题目
1、内控制度缺乏权威性。保证信用社的内控制度有效执行，必须建立有权威、有独立性的内控机构，这是建立信用社科学经营治理机制的需要。现实情况是，制度建立的多，真正执行的少。由于内部稽核职员是在联社的领导下，缺乏独立性，在对实施项目的检查中，面对查出新题目往往束手无策，只能在具体规范上作一些调整和纠正，很难对责任人作相应处理。
2、法人治理结构尚未真正建立。信用社固然按照规定成立了“三会”。制定了相关制度和具体规定，但就“三会”制度本身来说大多形同虚设，很多规定在实际操纵中难以执行，决策权、监视权、执行权在实际工作中没有得到有效分离，由此也就很难对信用社法人代表实施有效的监视制约。
3、制度不落实。从目前信用社发生的各类案件来看，很重要的原因是内控制度落实不到位，违规违章操纵不能得到及时的纠正。在业务经营上，偏重于规模发展，对于内控制度的建立和落实重视不够。
4、制度建设不规范。一些新业务的治理制度跟不上，无法适应业务发展的需要。而有的制度不完善，和信用社的治理实际脱节。制度制定不系统，信用社在内控制度建设中缺乏同一考虑，影响内控制度整体功能的发挥。
二、加强和完善内控制度的思路
1、理顺关系，完善机制，树立内控机构权威。稽核部分具有独立性、超脱性、权威性和同一性，联社不但要从工作部署上予以明确，而且要从体制、职权、职员配备和治理机制上予以保证，从而树立稽核工作的权威，减少各方面的行政干预和人为因素的影响。
2、按照现代企业制度规范，建立有效的法人治理结构，强化约束和制约机制。按照合作制原则，建立起真正的合作金融组织。在股权设置上，积极改善股权结构，实现股权结构的多元化；在内部治理上，完善和健全社员代表大会、理事会和监事会“三会”制度，建立决策、执行和监视三种职能相互联系、相互制约的法人治理结构，从组织形式上形成对法人代表的有效控制；健全议事规则和决策程序，防止权力的滥用和决策失误。
3、制度要果断落实到位，堵塞治理漏洞。加强内控机制建设，就必须把落实各项内控制度作为强化内部治理、防范风险的头等大事来抓。一是要落实责任，真正把责任落实到具体的责任人，以制度落实责任，用制度说话。二是要加强内部治理制度，严格业务工作环节和工作程序的监视检查，查出新题目及时解决。三是要加强考核评价。每一项工作结束后，都要组织相关职员按照预先规定和要求进行全面的考核和评价，向有关方面通报情况。
4、加强会计工作控制和治理，严格核算制度和具体操纵。要规范会计操纵规程，实行岗位分工，严禁一人兼岗或独立操纵业务全过程。会计核算严格执行权责发生制原则，真实反映经营情况，确保会计信息真实性和可靠性。
5、构建完善的治理监控制度体系。一是对现行的某些内控制度进行调整和修订。二是要制定和完善内部责任体系。三是要按照从严治社的原则，进一步完善对于违规行为和失职行为的责任追究制度体系。要制定同一的内控制度，力求内控制度体系具有完整性、同一性，并努力使其规范化、科学化。
6、建立联社和信用社主任年审和离任审计制度，年终由稽核部分对信用社年度经营治理、权力使用、制度执行、工作绩效等情况进行全面审计。
