经考古调查的五个地理位置，绿色的圆点所指示的地理位置被指出是继benedictow后的两种可能传播黑色死亡（鼠疫）的独立路径。
《日期：1371年10月 joumal（期刊） ppat、10011
34、9001》
与aDNA的结果相似，没有在反面的操作例子中或那些位置（表格1和s1）的土壤样品中检测到抗原。
总之，两种方法证明那些被埋入坟墓堆得人类是历史上和与上下文所写的黑色死亡以及它的再起有关联的，都始终是南方中部和北欧的鼠疫所感染，第二次大范围流行极大部分也可能是鼠疫引起的。
基因型分析：尽管我们的结果表明鼠疫杆菌与第二次大流行的关联，但没有确定出引起鼠疫的基因型，他们也没有确定出鼠疫杆菌与现有的能在当今引起疾病的细菌间的遗传关系。
通过ADNA对在glPD和naPA上得突变特征，我们实验古老的菌株引起大量的死亡，是否是由于古老东方的和远古的生物变形，我们可以通过PCR扩增和连续来自荷兰、法国和英格兰的个体的7—9 pla-positive的glPD基因库。与先前的结果大不相同，结果中没有包含与生物变型orientalis（TableS3）有联系时93pb glpD缺失的特征，与此同时的，从荷兰和英格兰（TableS3）四个pla-positive个体的Medievalis终止密码子在APA扩增结果中并不存在。因此，鼠疫（黑死病）的大肆传染既不是由于Orientalis也不是Medievalis。
Rpestis（鼠疫）突变体来自两万年前的祖先种reriniapseudotuberculosis，一个由三个基因组序列加其他分子作标记的对照组把模型菌株放在一个系统树（Fig、L)这个系统树是有L、ORL、O1和2三个待定的分支构成。大部分的Orientalis隔离群符合待定分友的单元组，而大多数的Medievalis隔离群符合另一个单元组待定分支
2、WED、古菌株在分支1
（
1、ANT）和分支2（
2、ANT）的其他群体中被发现，其它的被称为突变Pestoides的r、pestis菌株在沿着分支O(O、PE4)的各个群体中，我们试图通过测试在r、pestis由化树（Fip、
3）里标志着主要的系统分支，顶端的16个典型种系的单核苷酸的多态性来鉴定在我们的采样中引起第二次黑死病大范围流行基因。
这些SNPS（多态性）是从pla-positive个体中扩增和连续得来的，这些个体是足够多生物材料中有用的。一些有限的核苷酸差异由于DNA降解，在六个来自荷兰、两个来自英格兰和一个来自法国的黑色病毒受害者体内，这些核苷酸在目标SNP的位置能够正确地重复地的被确定结果证明r、pestis的基因型从14世纪的考古样本的鉴定得出它与现代的Orientalis（l、ORI）和Medievalis（2MED）是特殊的，同时也显示了它们和典型古菌也是不同的。不同的是基因型图是种系树分支
1、
2、3分离的部分，它们的基因型比种群O、PEL更经常涉及到，尽管O、PEL是在分支O上，由于它们有SNPs的衍生物种S8
1、S82和S87，然而它们比
1、ANT和
2、ANT
