《莫扎特传》开始于奥地利宫廷乐师萨里埃利向神父的忏悔。萨里埃利从偏僻小镇到了维也纳，在约瑟夫二世的王宫里当宫廷乐师。他对莫扎特的乐曲非常着迷，但自从发现这位人称4岁写协奏曲，7岁写交响乐，11岁写大型歌剧的天才音乐家原来是个放荡不羁，玩世不恭又十分傲慢的青年人后便感到十分嫉妒。特别是在约瑟夫二世国王喜爱莫扎特的音乐，把他留在维也纳写歌剧后。莫扎特的音乐才华更使萨里埃利在惊叹之余感到羞耻，为什么莫扎特有如此才华，自己却偏偏平庸。于是萨里埃里从中作梗，借助国王的名义，让莫扎特写的歌剧《费加罗的婚礼》《唐璜》等不朽之作，在剧院上演都不超过一星期。因此莫扎特的经济拮据，生活贫穷。萨里埃利一方面假装是最关心莫扎特的人，而另一方面却在暗中谋害他，甚至精神上折磨他，他装扮成神迷的黑衣人上门向莫扎特买乐曲，迫使他不停地交出作品换取报酬来维持生活，这使莫扎特的身体日趋虚弱。莫扎特创作并担任乐队的指挥的歌剧《魔笛》在剧院上演了，但莫扎特积劳成疾终于有一天在演出进行到一半时晕倒在地。莫扎特卧病在床，萨里埃利仍要他写《安魂曲》。病床上的莫扎特极度虚弱无法执笔，萨里埃利建议由他执笔而莫扎特则口述。莫扎特的灵感像泉水喷涌，萨里埃利甚至来不及记录。曲子完成了，莫扎特的生命之火也熄灭了。
影片中的萨里埃利看似是一个心中充满嫉妒与仇恨的卑鄙小人，是一个表面上对莫扎特嘘寒问暖，用心良苦，背地里却因为嫉恨莫扎特的才华而不断阻碍他在音乐方面前进的道路的伪君子。然而，最大的敌人往往也是最好的知己。萨里埃利是唯一真正懂得莫扎特的音乐
才华，对莫扎特惺惺相惜的人，实际上他所做的一切从另外一种角度诠释了天才是如何和这个世界格格不入的。大凡天才都不被世俗所理解与容忍，在他们的眼里天才是如疯子一般的异类，所以在影片里我们才会在一方面看到莫扎特的音乐天赋，被他的才华吸引，被他的音乐打动的同时为莫扎特悲惨的人生感到惋惜，为造物弄人感到无奈。莫扎特仿佛是上帝派来的使者，把最美好的音乐带到人间，却被贪嗔痴傻和愚昧的人类所遗弃。
美国音乐学者约瑟夫.马克利斯曾经这样评价莫扎特的音乐：\"在音乐历史中有这么一个时刻：各个对立面都一致了，所有的紧张关系都消除了。莫扎特就是那个灿烂的时刻。\"我们似乎可以这么计量莫扎特留给我们的宝藏：歌剧22部：其中以《费加罗的婚礼》、《唐.璜》、《魔笛》最为著名；交响曲41部：以第三十
九、四
十、四十一交响曲最为著名；钢琴协奏曲27部：以第二
十、二十
一、二十
三、二十
四、二十
六、二十七钢琴协奏曲最为著名；小提琴协奏曲6部，以第
四、第五小提琴协奏曲最为著名；此外，还有不计其数的各种体裁的器乐与声乐作品。到如今，依然愚昧的我们真的搞懂了这个天才给我们留下了什么吗？\"有耳朵可以听的，都听吧！\"
一代音乐大师永远离开了他无法适应的社会。下葬的那天，大雨滂沱，好像苍天也在为他哭泣……
