程序：
企业核算---企业报核---海关受理---海关核销。
（一）企业核算。财务、仓库、生产车间对加工贸易货物情况进行单损耗核算，清点成品、余料、边角料、残次品、副产品，整理单证。
（二）企业报核。报核行为是加工贸易企业应承担的一项法律义务。申报内容也是海关执法依据，企业需对所申报内容承担法律责任。申报内容为：如实申报进出口情况，单损耗、余料、残次品、边角料等情况。
（三）受理报核及海关核销。受理报核是对审核单是否齐全，纸质单证与海关电子数据是否一致，申报内容是否详实。
海关核销可采用单证核销和下厂核查核销两种方式。
单证核销。海关通过单证的审核，单耗和进出口平衡核算，直接核销。
下厂核销。海关对加工企业进行查账，查实物、查库存等手段进行的核销方式。
海关监管的是物，目的是防止物的流失。因此监管的重点是两个方面：一是确定料件已生产成成品出口；二是出口成品对料件的耗用。海关查账主要通过账上的物的流向和物的耗用，确定企业履行义务的真实性。
核查内容主要有：
1、原材料账与仓库台账，确定进口料件是否入库、入账，入库、入账的品名、数量、金额与手册是否一致，材料是否领用，有无余料。
核查生产成本账、技术资料、工艺流程图，计算产品单耗、损耗、总耗。
2、核查销售账，核对出口成品的金额、品名、数量，有无擅自内销。
3、了解边角料、包装物，确定其是否有使用价值。
4、必要时查看银行日记账、增值税发票存根联，并进行仓库盘点。
5、复印有关资料并加盖公章。
企业内部管理需要达到的四个要求：
1、专库存放。保税料件、成品有条件的应专库存放，无条件的也应该做到分列单批存放。在库房和账簿上有明显标记，以备海关核查。
2、专账登记。入库保税料件应严格按合同号及顺序进行专账登记。特别是来料加工必须做到以合同为单元的管理，做到先进先出、后进后出。同一合同做到账、物、卡三相符。
3、专人管理。便于配合企业报关员、核销管理员和海关核查工作。
4、专料专用。来料加工应严格坚持专料专用，不得互相串换。进料加工以合同为单元的管理模式，必须严格执行专料专用。
“四专”是海关对加工贸易企业内部对保税料件管理的基本要求，其目的是便于海关监管，便于企业内部对保税料件正常使用的管理，便于企业核算加强内部管理。
