我国国家级医学重点学科
第一军医大学
国家级重点学科（消化病、国家骨质疏松症诊疗研究中心、），2个国家中医药管理局重点学科（中医肾病学、中医脑病学），
南方医院 国家级重点学科-消化病研究所、国家骨质疏松症诊疗研究中心、拥有中医肾病学、中医脑病学等2个国家中医药管理局重点学科， 第二军医大学
国家高等学校重点建设学科（12个）
生理学、遗传学、免疫学、航海医学、内科学（消化系病）、影像医学与核医学、外科学（普外）、外科学（骨外）、外科学（胸心外）、外科学（烧伤）、中西医结合临床、药理学
东方肝胆外科医院，是在我国肝胆外科开拓者、著名肝胆外科专家、中国科学院院士吴孟超教授领导下，从 1958 年成立肝胆外科三人小组开始，经过 40 多年的自力更生、艰苦奋斗、奋发图强、勇攀高峰，由一个小组发展到集医、教、研为一体的院、所合一国内惟一的专科医院，已成为国家重点学科 第三军医大学
拥有烧伤外科、肝胆、防原医学、野战外科4个国家级重点学科， 西南医院 国家级重点学科2个(烧伤、肝胆)， 新桥医院2个国家级重点学科 防原医学 大坪医院 国家级重点学科（野战外科学）、
第四军医大学被批准为国家级重点学科有人体解剖学、微生物与免疫学、航空航天和航海医 学、口腔科学、（骨科、胸外科、脑外科、传染科、神经科学，创伤骨科学，心血管外科，）
西京医院6个国家级重点学科 神经科学，创伤骨科学，心血管外科，
唐都医院 骨科、胸外科、脑外科、传染科为国家级重点学科，中西医结合睡眠失调专病中心为国家专病中心，
秦都口腔医院,是我国著名的口腔医学界院校之一，是我国从事口腔医学教学科研、医疗的重要基地之一，国家级重点学科1个，口腔医学研究所， 301医院 耳鼻喉科-头颈外科、外科学(骨科)和老年医学为国家重点学科 南京军区总医院 建有国家重点学科1个
中国协和医科大学具有国家重点学科点18个，基础医学、临床医学、生物学、药学、公共卫生与预防医学、口腔医学、中西医结合、公共卫生管理、生物医学工程、图书馆情报与档案管理、哲学等、国家级重点实验室3个，部委级重点实验室9个。有国家级研究基地和中心17个。
首都医科大学 卫生部全科医学培训中心、临床医学研究所、基础医学研究所、神经科学研究所、眼科研究所、老年病医疗研究中心、泌尿外科研究所、心肺血管医疗研究中心、生命科学院、卫生毒理检测中心、生物工程技术研究中心、祖国医学研究所、临床疾病研究中心、中医肝病临床研究中心、生殖医学研究所、心血管疾病临床试验及社区干预中心和北京市卫生政策与卫生经济研究中心等。神经生物学、细胞生物学、电生理学、基础免疫学、实验寄生虫学、医学图像处理、生物医学、信息检测与处理、神经内科、神经外科、心脏内外科、肾移植、呼吸和消化内科、口腔颌面外科、眼科、耳鼻咽喉科、小儿血液病等领域在国内外享有较高声誉，很多学科的研究和医疗水平已经达到或接近国际先进水平。 北京中医药大学有6个国家级重点学科，10个部局级重点学科，
北京大学医学部由中国政府创立的第一所医学院校，有11个国家级重点学科点，1个国家级重点实验室，8个卫生部级重点实验室，11个联合研究中心，学科及专业齐全，现有基础医学、临床医学、预防医学(含预防医学、卫生事业管理、妇幼卫生)、口腔医学、药学(含药学、药物化学、药理学)、护理学、医学检验。现有36个博士学位授权点和46个硕士学位授权点，以培养本科生、研究生为主体，同时又是继续教育的培训基地。基础医学院被国家教育部确定为基础理科人才培养基地。
北京大学第三医院有国家级重点学科2个，\"211\"工程重点学科5个，卫生部临床重点学科3个。
北京大学第一医院肾脏疾病、心血管疾病、泌尿系肿瘤、结石、男性疾病、普通外科分流术、门静脉高压症、胰十二指肠切除术、甲状腺手术、大肠癌、大面积灼伤、妇科疾病、神经内科各类疾病、神经外科各类手术、眼科青光眼、儿童弱视、斜视、小儿神经、小儿肾脏、小儿心血管等疾病的防治与研究均居国内前列或世界先进。
阜外心血管病医院、是国家心血管病医疗、科研、预防和人才培养的重要基地；医院心血管外科是我国最大的心血管外科中心，也是世界大型心血管外科中心之一。是中国心血管技术协作培训中心、国家心血管新药临床试验研究中心所在地。 北京协和医院是一所以医疗为基础，集医疗、教学、科研为一体的大型综合性医院，是协和医科大学的临床学院，中国医学科学院的临床医学研究所，是卫生部指定的全国疑难危重病诊断治疗中心之一。医院有国家重点学科三个：心内科、血液内科、临床核医学科；中国医学科学院重点学科八个：内分泌学科、风湿免疫科、消化内科、妇产科、基本外科、皮肤科、放射与超声诊断科、病理科。世界卫生组织国际疾病分类合作中心一个。
中国医学科学院肿瘤研究所、肿瘤医院。该院是我国最大的癌症防治研究机构，也是世界卫生组织癌症协作中心之一。
北京大学药学院两个国家重点学科即药物化学和生药学。
中国医科大学设有1个国家重点学科，3个卫生部重点实验室，设有卫生部直属日语培训中心和中国乡村医生培训中心。小儿内外科疾病的诊疗技术和学术水平居国内领先地位，是全国儿科和新生儿的急救中心之一。内科呼吸系病、皮肤病与性病学2个国家重点学科；设有细胞生物学实验室、小儿先天畸形实验室、免疫皮肤病学实验室等3个卫生部重点实验室；设有基础医学、临床医学、生物学等3个博士后流动站；设有3个国家培训中心，2个国家药品研究基地，1个全国儿童抢救中心；
复旦大学医学院是中国人自己创办的第一所高等医学院校。有13个国家重点学科，1个国家理科基础科学和教学人才培养基地，9个“211工程”建设重点学科，10个卫生部临床重点学科，在科研方面，分子遗传、分子病毒、神经生物学、预防医学、中西医结合等保持国内领先地位；在临床医学研究方面，肝癌临床、新喉再造、颅底显微外科、臂丛根性撕脱伤等研究达国际先进水平。 复旦大学附属中山医院心脏、肝癌、肾脏和肺部疾病诊治是医院的重点和特色，诊治水平始终处于国内领先地位。 复旦大学附属华山医院神经外科、手外科、中西医结合科、泌尿外科、神经内科、传染病学和抗生素、肾病科、心血管科、影像医学和核医学、普外科为国家级重点学科
瑞金医院3个国家教育部重点学科、国家重点实验室1个（医学基因组学重点实验室）、卫生部重点实验室2个（卫生部内分泌与代谢病重点实验室、人类基因组重点实验室）；医院在肾脏内科、消化内科、内分泌、高血压、中医伤科、急性坏死性胰腺炎、生殖医学等学科中颇具特色，
上海交通大学附属第六人民医院1963年陈中伟教授、钱允庆教授等在我院成功地施行了国际医学史上第一例断肢再植手术，从此医院被誉为我国断肢再植的摇篮。20世纪五十年代末周永昌教授等开创了超声医学事业，被誉为“中国超声诊断发源地”。
上海第二医科大学附属仁济医院是上海开埠后第一所西医医院，她是我国历史最悠久的综合性西医医院之一，是中国近代医学的摇篮…… 上海第二医科大学2个为国家教委行政重点学科， 天津医科大学中西医结合临床（外科）为国家级重点学科
哈尔滨医科大学中国地方病防治研究中心、国家基础科学研究和教学人才培养基地、卫生部卫生管理干部培训中心、卫生部俄语培训中心 重庆医科大学现有国家级重点学科1个，即传染病学；
南京医科大学 有3个国家重点学科培育点（基础医院、临床医学、公共卫生与预防医学）
华中科技大学同济医学院，建有5个国家级重点学科，２个卫生部重点实验室，１个卫生部临床药理基地，卫生部德语培训中心设在我院。
中山医科大学有三个国家重点学科：眼科学、寄生虫学、内科学（肾病）
白求恩医科大学有2个国家级重点学科，1个部级重点实验室，4个卫生部批准的和15个吉林省批准的研究所，在免疫学、病理学等学科领域具有国内领先地位。
华西医科大学国家重点学科口腔科学（口外、口矫）其牙科在中国设立最早，是中国口腔医学的发源地，培养了大批国内外享有盛誉的口腔医学教授、研究人员和专科医师，是培养中国口腔学术人才的重要基地。
湖南医科大学1个国家级重点实验室（医学遗传学）、2个部省级重点实验室（癌变原理、心血管研究）、1个国家级重点学科（病理生理学）、3个博士后流动站（基础医学、临床医学、生物学）和医学遗传学、临床药理、英语、医疗仪器设备维修、肝胆肠外科、医用高压氧、医院感染控制等7个国家或部级培训（研究）中心。
湘雅医院 国家重点神经病学
江西医学院设有国家干细胞工程技术研究中心江西省分中心，
