1原生质体：脱去细胞壁的细胞叫原生质体。
2芽孢： 芽孢就是有些细菌（多为杆菌）在一定条件下，细胞质高度浓缩脱水所形成的一种抗逆性很强的球形或椭圆形的休眠体。
3菌落：由单个细菌（或其他微生物）细胞或一堆同种细胞在适宜固体培养基表面或内部生长繁殖到一定程度，形成肉眼可见的子细胞群落。
4诱导酶： (induced enzyme)是在环境中有诱导物（通常是酶的底物）存在的情况下，由诱导物诱导而生成的酶。
5生长因素：是指影响微生物生长的因素，包括温度，辐射，氧气，水分，PH值，化学因子等。
6回复突变：突变体(mutant)经过第二次突变又完全地或部分地恢复为原来的基因型和表现型。
7诱导：某些环境因子的刺激使基因或操纵子进入转录状态。
8拮抗：是指不同激素对某一生理效应发挥相反的作用从而稳定身体内环境的作用。 9血清学反应：是指相应的抗原和抗体在体外进行的结合反应。由于抗体主要存在于血清中，进行这类反应时一般都要用含有抗体的血清作为实验材料，所以把体外的抗原、抗体反应称为血清学反应。
10巴斯德效应：由于葡萄糖在有氧呼吸中产生的能量要比在发酵中产生的多得多，所以在有氧条件下，兼性厌氧微生物终止厌氧发酵而转向有氧呼吸，这种呼吸抑制发酵的现象称为巴斯德效应。
11质粒：是附加到细胞中的非细胞的染色体或核区DNA原有的能够自主复制的较小的DNA分子（即细胞附殖粒、又胞附殖粒）。
12生长因子：具有刺激细胞生长活性的细胞因子。一类通过与特异的、高亲和的细胞膜受体结合，调节细胞生长与其他细胞功能等多效应的多肽类物质。
13光复活作用：经紫外线照射后的微生物立即暴露于可见光下时，可明显降低其死亡率的现象，称为光复活作用。
14活性污泥：活性污泥(activesludge)是微生物群体及它们所依附的有机物质和无机物质的总称．微生物群体主要包括细菌，原生动物和藻类等．其中，细菌和原生动物是主要的二大类．活性污泥主要用来处理污废水。
15营养型缺陷：因丧失合成某些生活必需物质的能力，不能在基本培养基上生长的，突变型菌株。
16BOD：生化需氧量或生化耗氧量(五日化学需氧量)，表示水中有机物等需氧污染物质含量的一个综合指示。
17温和性噬菌体：指噬菌体感染细胞后，将其核酸整合(附着)到宿主的核DNA上，并且可以随宿主DNA的复制而进行同步复制， 18埃姆斯试验（Ames test）：利用细菌营养缺陷型的回复突变来检测环境或食品中是否存在化学致癌剂的简单方法。
19ELISA： 是酶联接免疫吸附剂测定的简称
20PCR：聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction)是一种分子生物学技术，用于放大特定的DNA片段。可看作生物体外的特殊DNA复制。
21类毒素：由于变性或化学修饰而失去毒性的毒素，但仍保留其抗原性。
22暗修复作用：是指照射过紫外线的细胞的DNA，不需要可见光的反应而修复，使细胞的增殖能力恢复的过程。
23转化：受菌体直接吸收供菌体的DNA片段而获得后者部分遗传现象的现象。
24半抗原：能与对应抗体结合出现抗原-抗体反应、又不能单独激发人或动物体产生抗体的抗原。
25操纵子：指启动基因、操纵基因和一系列紧密连锁的结构基因的总称。
26BOD5：五日生化需氧量。表示水中有机物含量的间接指标。一般指在20℃下，1L污水中所含的有机物（主要是有机碳源），在进行微生物氧化时，5日内所消耗的分子氧的毫克数。
27单细胞蛋白，也叫微生物蛋白，它是用许多工农业废料及石油废料人工培养的微生物菌体。
28噬菌斑：噬菌斑是指在宿主细菌的菌苔上，噬菌体使菌体裂解而形成的空斑。
29基因工程：又称基因拼接技术和DNA重组技术，是以分子遗传学为理论基础，以分子生物学和微生物学的现代方法为手段，将不同来源的基因按预先设计的蓝图，在体外构建杂种DNA分子，然后导入活细胞，以改变生物原有的遗传特性、获得新品种、生产新产品。 30半孢晶体：芽胞杆菌属中的有些种，在形成芽胞的同时，在细胞内部产生一种晶体状多肽类内含物。如苏云金杆菌，形成的晶体一般为菱形、方形或不规则形状，它是一种毒性晶体，对一百多种鳞翅目昆虫有毒性作用，对人畜很安全，现已用为生物杀虫剂。
31次生代谢物：是指某些微生物生长到稳定期前后，以结构简单、代谢途径明确、产量较大的初生代谢物为前体，通过复杂的次生代谢途径所合成的各种结构复杂的化合物。 32接合孢子：是接合菌的有性孢子,由菌丝长出形态相同或略有不同地配子囊接合而成。 32局限性传导：指通过部分缺陷的温和噬菌体把供体菌的少数特定基因携带到受体菌中，并与后者的基因整合、重组，形成转导子的现象。
33碳源物质：一切能满足微生物生长繁殖所需碳元素的营养物。
34基团移位：基团转位是一种特殊的主动运输，与普通的主动运输相比，营养物质在运输的过程中发生了化学变化（糖在运输的过程中发生了磷酸化）。其余特点与主动运输相同。基团转位主要存在于厌氧和兼性厌氧型细菌中，主要是用于单（或双）糖与糖的衍生物，以及核苷与脂肪酸的运输 。
35移码突变：指诱变剂使DNA分子中增加（插入）或缺失一个或少数几个核苷酸，从而使该部位后面的全部遗传密码的阅读框架发生改变，并进一步引起转录和转译错误的一类突变。
36准性生殖：是一种类似于有性生殖但比它更为原始的生殖方式，它是同一生物的两个不同来源的体细胞经融合后，不经过减数分裂而导致低频率的基因重组，准性生殖常见于半知菌中。
37巴斯德灭菌：巴斯德灭菌法是一种加热食品，或其他食用原料，以消灭细菌,或防止食品变坏的方法。
38连续灭菌：连续灭菌也叫连消，就是将将配制好的并经预热（60～75℃）的培养基用泵连续输入由直接蒸汽加热的加热塔，使其在短时间内达到灭菌温度（126～132℃）。然后进入维持罐（或维持管），使在灭菌温度下维持5～7分钟后再进入冷却管，使其冷却至接种温度并直接进入已事先灭菌（空罐灭菌）过的发酵罐内。其过程均包括加热、维持和冷却等灭菌操作过程。培养基的冷却方式有喷淋冷却式、真空冷却式、薄板换热器式几种方式。 39HFR菌株：高频重组菌株。指细菌接合时，将染色体以高频率传递给雌性菌（F-菌）而形成重组体的雄性菌。细菌含有F因子，并且F因子通过交换整合到主染色体上，这样的细菌叫Hfr菌株。
40对数生长期：当微生物生长一定阶段后，微生物的比生长速度达到最大，此时进入对数生长期，在对数生长期中若没有抑制或限制微生物生长的因素存在，因而微生物保持一个恒定的最大的比生长速度生长，细胞数量呈指数递增。 41prophago： 42prototroph：
43孢囊孢子： 接合菌亚门无性生殖产生的孢子，接合菌无性繁殖所产生的孢子生在孢子囊内，孢子囊一般生于营养菌丝或孢囊梗的顶端。 。
44子囊孢子：子囊菌的有性配子或生于子囊内的有性配子叫子囊孢子
45PFU：噬菌斑形成单位 plaque forming unit，缩写pfu。指在培养于琼脂培养基上的细菌，或在单层培养的动物细胞上形成一个噬菌斑的病毒数。
46CFU：活菌计数。为将样品用无菌生理盐水进行系列稀释，取合适的稀释度（一般3个稀释度），以涂布法接种于平板，或以混碟法进行操作，经过一定时间的培养之后，直接统计平板上的菌落。该方法测定的是样品中所含的现时可培养的活的微生物数量，所以称之为活菌计数法。
47斜面保藏法：将菌种接种在适宜的固体培养基上，待菌生长充分以后，转移至2-8度冰箱中保藏。
48冷冻干燥法：是将材料冻结后，先冷却到冻结温度以下，再在低温和真空条件下使材料中冻结成冰的水分直接蒸发成水汽（升华），并冷凝除水的食品干燥新方法。
49基因文库：一个生物体的基因组DNA用限制性内切酶部分酶切后，将酶切片段插入到载体DNA分子中，所有这些插入了基因组DNA片段的载体分子的集合体，将包含这个生物体的整个基因组，也就是构成了这个生物体的基因文库。
50cDNA文库：以mRNA为模板，经反转录酶催化，在体外反转录成cDNA，与适当的载体（常用噬菌体或质粒载体）连接后转化受体菌，则每个细菌含有一段cDNA，并能繁殖扩增，这样包含着细胞全部mRNA信息的cDNA克隆集合称为该组织细胞的cDNA文库。
51生物膜：镶嵌有蛋白质和糖类（统称糖蛋白）的磷脂双分子层，起着划分和分隔细胞和细胞器作用生物膜，也是与许多能量转化和细胞内通讯有关的重要部位，同时，生物膜上还有大量的酶结合位点。细胞、细胞器和其环境接界的所有膜结构的总称。
52嗜高温噬菌体：
53增值培养：指从微生物混合群开始对特定种的数量比例不断增高而引向纯培养的一种培养方法。
54高压蒸汽灭菌法：高压蒸汽灭菌法（autoclaving） 可杀灭包括芽胞在内的所有微生物，是灭菌效果最好、应用最广的灭菌方法。方法是将需灭菌的物品放在高压锅（autoclave）内，加热时蒸汽不外溢，高压锅内温度随着蒸汽压的增加而升高。在103.4kPa（1.05kg/cm2）蒸汽压下，温度达到121.3℃，维持15～20分钟。
55Biofilm：镶嵌有蛋白质和糖类（统称糖蛋白）的磷脂双分子层，起着划分和分隔细胞和细胞器作用生物膜，也是与许多能量转化和细胞内通讯有关的重要部位，同时，生物膜上还有大量的酶结合位点。细胞、细胞器和其环境接界的所有膜结构的总称。
56Peptideglycan：肽聚糖存在于原核生物细胞壁的大分子聚合物，是由乙酰氨基葡萄糖、乙酰胞壁酸与四五个氨基酸短肽聚合而成得多层网状大分子结构。 57Escherichia coli (Migula) Cvastellani et Chalmers 1919： 58益生菌：是指投入后通过改善宿主肠道菌群生态平衡而发挥有益作用，达到提高宿主（人和动物）健康水平和健康佳态的活菌制剂及其代谢产物。
59EMB：糖酵解途径。以一份子葡萄糖为底物，约经十步反应而产生2分子丙酮酸、2分子NADH+H和2分子ATP的过程。 60国标：
61同型乳酸发酵：由EMP途径而进行的乳酸发酵。
62荚膜：是某些细菌在细胞壁外包围的一层粘液性物质，一般由糖和多肽组成。
63选择性培养基：是指根据某种微生物的特殊营养要求或其对某化学、物理因素的抗性而设计的培养基。
64溶源转变：当温和噬菌体感染宿主而使其发生溶源化时，因噬菌体的基因整合到宿主的核基因组上，而使后者获得了除免疫性以外的新性状的现象，称为溶源转变。
65大肠菌群：指的是具有某些特性的一组与粪便污染有关的细菌，这些细菌在生化及血清学方面并非完全一致，其定义为：需氧及兼性厌氧、在37℃能分解乳糖产酸产气的革兰氏阴性无芽胞杆菌。
66原噬菌体：某些温和噬菌体侵染细菌后，其核酸整合到宿主细菌染色体中。处于整合状态的噬菌体DNA称为原噬菌体。
67三域学说：20世纪70年代末由于美国伊利诺斯大学的C.R.Woese（伍斯）等人对大量微生物和其他生物进行16s和18srRNA的寡核苷酸测序，并比较其同源性水平后，提出了一个与以往各种界级分类不同的新系统，称为三域学说，“域”是一个比界更高的界级分类单元，过去曾称原界。三个域指的是细菌域（以前称“真细菌域”）、古生菌域（以前称古细菌域）、和真核生物域。
68SOS修复：指DNA受到严重损伤、细胞处于危急状态时所诱导的一种DNA修复方式，修复结果只是能维持基因组的完整性，提高细胞的生成率，但留下的错误较多，故又称为错误倾向修复（error-prone repair），使细胞有较高的突变率。
