学校内部管理总的思路是：建立学校统一领导、学部直接管理、中心服务协调的工作格局。管理系统分为三个层次：议事与决策系统、指挥与实施系统、服务与协调系统。具体为：“五会五部九中心”。
（1）议事与决策系统（五会）：党委会、教代会、校长办公会、行政办公会、学校办学委员会（含社会、家长、学生）。
（2）指挥与实施系统（五部）：高
一、高
二、高三三个年级教学部、艺体专业部、教育国际交流与合作部。主要职责是：负责本学部教学及学生管理工作；负责本学部教师（职员）聘任、专业发展及考核工作；负责本学部教学用房、环境卫生及物资管理工作（节水、节电、公物管理）。
（3）服务与协调系统（九中心）：
行政服务中心：主要负责校务、纪检、工会、老干、女工委员会、文档、对外联系、来访接待、车辆管理与调度等。
人力资源中心：主要负责学校的日常党务及组织发展工作；负责人事管理与监督：人员编制、调配、档案管理、工资核定、职称评定、教师（职员、临时工）工作量、加班认定等。
课程资源中心：主要负责学校图书购置，教材、教辅资料征订；校园网络维护和更新；负责校本课程研发；协调学科竞赛（奥赛、科技创新大赛、英语创新大赛）等；负责校园电视台、图书馆、实验楼、物理馆的日常管理工作；负责学校有关录像工作。
学生发展中心：主要职责：团委（发展团员），学生会，校级社团组织，学生文体、艺术、科技等活动的设计和组织，家长委员会，学生评优树先，班主任培训与管理、劳动课的组织与管理等。
教师发展中心：主要负责教学质量标准的制定、教育教学质量评价、监测、交流反馈；牵头负责学校教科研工作；负责教师专业发展，教学一线奖励人选的提名、推荐；负责选课、学分认定、考勤的网络管理与实施，负责学籍管理工作；负责中考、高考等大型考试的考务管理及中考招生、高校招生的组织与协调工作。
安全保卫中心：主要负责学校安全、保卫，户籍管理、监控维护、法制教育等。
后勤保障中心：主要负责餐厅、超市、校医院、纯净水厂、眼镜店、校产管理、绿化、维修、设备购置、物资采购、基本建设、学校基建规划、突发疾病防治、协调教职工宿舍区综合治理等工作。
财务结算中心：主要负责收费、结算，财务规划、成本核算、工资（含绩效工资）发放、财务管理、奖励基金、清理欠款、内部审计等工作。
公寓管理中心：主要负责对学生公寓的管理及午、晚休纪律，设施维护、公寓卫生、公寓文化管理工作。
