农村党支部是党在农村的全部工作和战斗力的基础。但是，计划经济时期形成的党支部设置形式，部分已不适应农村改革开放进入新阶段和我国加入世贸组织的新情况。目前，农村存在着影响和削弱基层党组织因素，大体有以下几种：
----农民生产经营的相对独立性、经营方式和社会生活的分散性，削弱了党组织凝聚力、战斗力。农村实行家庭联产承包责任制以来，农民成了相对独立的经营主体，村级党组织较少直接参与生产经营，而是只是负责一些日常事务，农民很少就生产经营方面的问题来找党组织，对党组织的依赖程度逐步下降。
----村级组织对农民的管理范围、内容相对缩小减少。农民经营自主，来去自由，党组织既难掌握其行踪，更难了解思想。农村有这么一句顺口溜：“有田有粮不找你，不偷不抢不怕你，外出赚钱不理你，出了问题就找你，不给解决就骂你，解决不好就告你”。虽失之偏颇，但说明了农民已“散了心”和党组织凝聚力弱化的现象存在。加之有的村常年不开会，有的想开会也开不起来，教育弱化，管理松懈，使不少农民不关心集体事情，不尽集体义务，党组织既无法可依，又无章可循，久而久之，就丧失了权威。
----村集体经济薄弱，削弱了农民对党组织的感情。一些村级集体经济“空壳村”，党组织缺少提供服务的手段，办什么事都向农民伸手，致使有些农民感到村支部光会收粮收款、刮宫流产，党支部说话越来越不灵，威信越来越低。
----由于党组织缺少服务的实力和手段，使农民转而依靠宗族势力。对农民一家一户办不了，办不好的事，有的党组织不管不问，有的帮不了干不好。于是农民就转而求助于关系亲近的人，促成了以血缘、姻亲关系为纽带的同一宗族的联合，并且因利益息息相关，使得这种联合越来越巩固，逐步形成一股势力，对农村政治生活产生了十分不利的影响。宗族、家族势力的干扰，导致了党的方针政策和上级决议指示的难以执行，也使党组织的权威和影响力受到弱化。
----入世后随着农村剩余劳动力向城市转移，农村基层组织中，村官难选，干部难管，后继乏人的问题更加突出，导致了干部队伍素质偏低，创造力、战斗力和凝聚力进一步弱化。个别村几乎所有的党员部轮换一遍，始终也未找着合适的人选。
----村级两委关系不协调，削弱了党支部的领导核心地位。一些村委与村支部比高低，论大小，争权利，这些村出现了党的影响力弱化的倾向，是对党支部领导核心地位的严峻挑战。
