机关设置
秘书局
处室：办公室、党办人事处、综合调研处、文书通信处、法规室、档案室、督促检查室、技术室、图书资料室、音像室、印刷厂等
人事局
处 室：办公室、一处、二处、三处、四处、五处、六处、七处、八处、九处、十处、十一处等 机要局
处 室：办公室、党办人事处、通信处等
机要交通局
处 室：办公室、党办人事处、通信处、交通处等
警卫局
处 室：办公室、党办人事处、值班室、管理处、服务处、一处、二处、三处、四处、五处等
老干部局
处 室：办公室、党办人事处、行政处、万寿路俱乐部、文津俱乐部（内设总务处、接待服务处、活动处等）等
调研局
处 室：办公室、一组、二组、三组、四组、五组、六组、七组、八组、政治组、经济组、农业科技组等 特别会计室
处 室：办公室、业务一处、业务二处等
毛主席纪念堂管理局
处 室：党办人事处、行政处、宣传教育处、接待处、科技处、机电一处、机电二处、服务处、保卫处等 中共中央直属机关事务管理局
处室：办公室、服务接待办公室、机关服务处、行政管理处、会计管理处、卫生处、培训处、基建投资管理处、后勤改革与业务指导处、房地产管理处、万寿路管理处、中直机关审计室、中直机关住房制度改革办公室、中直机关人防办公室、中直机关绿化办公室、中直机关采购中心、北戴河接待办公室（内设办公室、秘书处、行政处、财务处、修建处、服务处、接待处、园林绿化处等）
中央档案馆（国家档案局）
处室：办公室、综合科教司、馆室司、政策法规研究司、行政财务司、经济科技司、外事办公室、档案资料保管部、档案资料利用部、信息管理中心等
中央保密委员会办公室（中央保密办、国家保密局）
处 室：综合处、法规室、科技处、宣传教育处、新闻处、财务处、督导处、销毁中心等
中央密码工作领导小组办公室（中央密码办、国家密码管理局）
处室：党办人事处、综合处、法规室、督查室、财务处、业务指导处、科技管理处、普密管理处、专控管理处、国家商用密码管理办公室（商密办）、通信中心等
机关党委
处 室：组织处、机关党校等
中央保健委员会（保健委，办公室设于卫生部保健局）
直属事业单位
北京电子科技学院
